Vad är skillnaden mellan agarosgelelektrofores och polyakrylamidgeler?

Agar är tillverkad av agaros, en polysackarid från se ogräs. Polyakrylamid är tillverkad av syntetiska polymerisation av akrylamid, som i sin monomera form är ett nervgift. Baserat på dessa strukturella skillnader, kan man säga att agaros gel har större porer än polyakrylamidgeler vilket innebär att stora partiklar kan gå lättare i agaros gel sedan agaros polymerer är större och packa mindre tätt då motsvarande mängd polyakrylamid. Därför används vanligen agaros för elektrofores av stora molekyler som DNA och RNA eller snabb separation (låg upplösning) av små molekyler som proteiner. Polyakrylamid används för högupplösta elektrofores av små molekyler som proteiner.